منذ توليه شؤون الحكم، في يوليوز 1999، أصدر الملك محمد السادس أوامر بالعفو عن 306.550 شخصا. الإحصائيات التي كشفت عنها المندوبية العامة لإدارة السجون وإعادة الإدماج، أشارت إلى أن العفو الملكي شمل تقليص عقوبات سجنية أو تخفيض غرامات مالية.
واستفاد من العفو الملكي محكومون في قضايا الإرهاب كذلك، حيث تم العفو عن 16 شخصا، كما تم تخفيض عقوبة أحدهم من حكم بالإعدام إلى عقوبة حبسية حددت مدتها في 30 سنة.